Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COL9A2Q14055 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COL9A2Q14055 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
COL9A2Q14055 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL9A2Q14055 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL9A2Q14055 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL9A2Q14055 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL9A2Q14055 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL9A2Q14055 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL9A2Q14055 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL9A2Q14055 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL9A2Q14055 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL9A2Q14055 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL9A2Q14055 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL9A2Q14055 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL9A2Q14055 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL9A2Q14055 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
COL9A2Q14055 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
COL9A2Q14055 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL9A2Q14055 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL9A2Q14055 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL9A2Q14055 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL9A2Q14055 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL9A2Q14055 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL9A2Q14055 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL9A2Q14055 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL9A2Q14055 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL9A2Q14055 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL9A2Q14055 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL9A2Q14055 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL9A2Q14055 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL9A2Q14055 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL9A2Q14055 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL9A2Q14055 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL9A2Q14055 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL9A2Q14055 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL9A2Q14055 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COL9A2Q14055 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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