Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
GTF2H3Q13889 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms