Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PKP1Q13835 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PKP1Q13835 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
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