Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOFQ13790 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOFQ13790 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOFQ13790 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOFQ13790 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOFQ13790 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOFQ13790 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOFQ13790 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOFQ13790 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOFQ13790 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOFQ13790 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOFQ13790 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOFQ13790 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOFQ13790 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOFQ13790 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOFQ13790 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOFQ13790 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOFQ13790 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOFQ13790 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOFQ13790 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOFQ13790 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOFQ13790 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOFQ13790 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOFQ13790 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOFQ13790 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOFQ13790 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOFQ13790 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOFQ13790 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOFQ13790 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
APOFQ13790 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOFQ13790 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOFQ13790 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOFQ13790 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOFQ13790 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOFQ13790 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOFQ13790 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOFQ13790 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOFQ13790 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOFQ13790 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOFQ13790 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
APOFQ13790 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOFQ13790 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOFQ13790 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOFQ13790 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOFQ13790 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
APOFQ13790 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOFQ13790 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOFQ13790 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOFQ13790 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOFQ13790 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOFQ13790 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOFQ13790 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOFQ13790 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOFQ13790 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOFQ13790 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOFQ13790 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOFQ13790 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
APOFQ13790 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOFQ13790 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOFQ13790 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOFQ13790 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOFQ13790 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOFQ13790 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOFQ13790 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOFQ13790 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOFQ13790 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOFQ13790 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOFQ13790 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOFQ13790 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOFQ13790 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOFQ13790 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOFQ13790 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOFQ13790 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
APOFQ13790 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOFQ13790 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
APOFQ13790 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOFQ13790 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOFQ13790 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOFQ13790 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOFQ13790 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOFQ13790 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOFQ13790 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOFQ13790 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOFQ13790 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOFQ13790 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOFQ13790 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOFQ13790 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOFQ13790 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOFQ13790 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOFQ13790 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOFQ13790 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
APOFQ13790 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
APOFQ13790 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
APOFQ13790 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
APOFQ13790 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
APOFQ13790 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
APOFQ13790 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
APOFQ13790 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
APOFQ13790 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
APOFQ13790 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
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