Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
RUNX3Q13761 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RUNX3Q13761 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
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