Protein–RNA interactions for Protein: Q13491

GPM6B, Neuronal membrane glycoprotein M6-b, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPM6BQ13491 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GPM6BQ13491 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms