Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

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Length 1,484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
GRIN2BQ13224 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
GRIN2BQ13224 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
GRIN2BQ13224 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
GRIN2BQ13224 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
GRIN2BQ13224 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
GRIN2BQ13224 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
GRIN2BQ13224 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
GRIN2BQ13224 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
GRIN2BQ13224 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
GRIN2BQ13224 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
GRIN2BQ13224 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
GRIN2BQ13224 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
GRIN2BQ13224 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
GRIN2BQ13224 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
GRIN2BQ13224 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
GRIN2BQ13224 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
GRIN2BQ13224 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
GRIN2BQ13224 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
GRIN2BQ13224 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC31.03■■■□□ 2.56
GRIN2BQ13224 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
GRIN2BQ13224 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
GRIN2BQ13224 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
GRIN2BQ13224 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
GRIN2BQ13224 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
GRIN2BQ13224 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
GRIN2BQ13224 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
GRIN2BQ13224 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
GRIN2BQ13224 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
GRIN2BQ13224 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
GRIN2BQ13224 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
GRIN2BQ13224 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
GRIN2BQ13224 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
GRIN2BQ13224 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
GRIN2BQ13224 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
GRIN2BQ13224 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
GRIN2BQ13224 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
GRIN2BQ13224 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
GRIN2BQ13224 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
GRIN2BQ13224 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
GRIN2BQ13224 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
GRIN2BQ13224 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
GRIN2BQ13224 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
GRIN2BQ13224 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
GRIN2BQ13224 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
GRIN2BQ13224 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
GRIN2BQ13224 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
GRIN2BQ13224 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
GRIN2BQ13224 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
GRIN2BQ13224 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
GRIN2BQ13224 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
GRIN2BQ13224 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
GRIN2BQ13224 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
GRIN2BQ13224 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
GRIN2BQ13224 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
GRIN2BQ13224 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
GRIN2BQ13224 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
GRIN2BQ13224 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
GRIN2BQ13224 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
GRIN2BQ13224 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
GRIN2BQ13224 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
GRIN2BQ13224 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
GRIN2BQ13224 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
GRIN2BQ13224 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
GRIN2BQ13224 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
GRIN2BQ13224 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
GRIN2BQ13224 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
GRIN2BQ13224 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
GRIN2BQ13224 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
GRIN2BQ13224 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
GRIN2BQ13224 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC31■■■□□ 2.55
GRIN2BQ13224 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
GRIN2BQ13224 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
GRIN2BQ13224 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
GRIN2BQ13224 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
GRIN2BQ13224 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
GRIN2BQ13224 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
GRIN2BQ13224 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
GRIN2BQ13224 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
GRIN2BQ13224 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
GRIN2BQ13224 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC31■■■□□ 2.55
GRIN2BQ13224 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
GRIN2BQ13224 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
GRIN2BQ13224 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
GRIN2BQ13224 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC31■■■□□ 2.55
GRIN2BQ13224 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
GRIN2BQ13224 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
GRIN2BQ13224 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
GRIN2BQ13224 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
GRIN2BQ13224 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
GRIN2BQ13224 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
GRIN2BQ13224 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
GRIN2BQ13224 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC30.99■■■□□ 2.55
GRIN2BQ13224 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
GRIN2BQ13224 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
GRIN2BQ13224 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
GRIN2BQ13224 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
GRIN2BQ13224 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
GRIN2BQ13224 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
GRIN2BQ13224 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
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