Protein–RNA interactions for Protein: Q13042

CDC16, Cell division cycle protein 16 homolog, humanhuman

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Length 620 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC16Q13042 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CDC16Q13042 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDC16Q13042 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDC16Q13042 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDC16Q13042 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CDC16Q13042 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDC16Q13042 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDC16Q13042 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDC16Q13042 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CDC16Q13042 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDC16Q13042 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDC16Q13042 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDC16Q13042 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDC16Q13042 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDC16Q13042 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDC16Q13042 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDC16Q13042 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDC16Q13042 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDC16Q13042 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDC16Q13042 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDC16Q13042 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDC16Q13042 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDC16Q13042 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDC16Q13042 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDC16Q13042 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDC16Q13042 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDC16Q13042 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDC16Q13042 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDC16Q13042 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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CDC16Q13042 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDC16Q13042 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDC16Q13042 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDC16Q13042 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDC16Q13042 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDC16Q13042 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDC16Q13042 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDC16Q13042 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDC16Q13042 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDC16Q13042 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDC16Q13042 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDC16Q13042 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDC16Q13042 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDC16Q13042 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDC16Q13042 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDC16Q13042 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDC16Q13042 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CDC16Q13042 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDC16Q13042 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDC16Q13042 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDC16Q13042 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDC16Q13042 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDC16Q13042 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDC16Q13042 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDC16Q13042 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CDC16Q13042 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDC16Q13042 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDC16Q13042 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDC16Q13042 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDC16Q13042 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
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