Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GRIK2Q13002 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GRIK2Q13002 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GRIK2Q13002 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GRIK2Q13002 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
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