Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
BNIP1Q12981 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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