Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NPRL3Q12980 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms