Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAF2Q12933 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAF2Q12933 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms