Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
SMARCB1Q12824 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SMARCB1Q12824 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
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