Protein–RNA interactions for Protein: Q12774

ARHGEF5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF5Q12774 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ARHGEF5Q12774 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ARHGEF5Q12774 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ARHGEF5Q12774 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ARHGEF5Q12774 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ARHGEF5Q12774 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ARHGEF5Q12774 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ARHGEF5Q12774 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ARHGEF5Q12774 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
ARHGEF5Q12774 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ARHGEF5Q12774 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ARHGEF5Q12774 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ARHGEF5Q12774 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ARHGEF5Q12774 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ARHGEF5Q12774 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
ARHGEF5Q12774 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ARHGEF5Q12774 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ARHGEF5Q12774 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ARHGEF5Q12774 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ARHGEF5Q12774 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ARHGEF5Q12774 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ARHGEF5Q12774 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARHGEF5Q12774 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARHGEF5Q12774 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARHGEF5Q12774 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARHGEF5Q12774 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARHGEF5Q12774 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARHGEF5Q12774 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARHGEF5Q12774 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARHGEF5Q12774 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
ARHGEF5Q12774 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARHGEF5Q12774 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARHGEF5Q12774 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARHGEF5Q12774 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARHGEF5Q12774 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARHGEF5Q12774 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARHGEF5Q12774 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARHGEF5Q12774 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARHGEF5Q12774 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARHGEF5Q12774 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARHGEF5Q12774 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARHGEF5Q12774 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARHGEF5Q12774 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARHGEF5Q12774 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
ARHGEF5Q12774 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
ARHGEF5Q12774 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARHGEF5Q12774 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ARHGEF5Q12774 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ARHGEF5Q12774 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ARHGEF5Q12774 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ARHGEF5Q12774 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ARHGEF5Q12774 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
ARHGEF5Q12774 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ARHGEF5Q12774 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ARHGEF5Q12774 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ARHGEF5Q12774 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ARHGEF5Q12774 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ARHGEF5Q12774 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ARHGEF5Q12774 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ARHGEF5Q12774 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ARHGEF5Q12774 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ARHGEF5Q12774 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ARHGEF5Q12774 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
ARHGEF5Q12774 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
ARHGEF5Q12774 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ARHGEF5Q12774 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ARHGEF5Q12774 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
ARHGEF5Q12774 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ARHGEF5Q12774 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ARHGEF5Q12774 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ARHGEF5Q12774 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
ARHGEF5Q12774 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ARHGEF5Q12774 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
ARHGEF5Q12774 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ARHGEF5Q12774 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ARHGEF5Q12774 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ARHGEF5Q12774 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ARHGEF5Q12774 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ARHGEF5Q12774 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ARHGEF5Q12774 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ARHGEF5Q12774 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ARHGEF5Q12774 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ARHGEF5Q12774 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ARHGEF5Q12774 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ARHGEF5Q12774 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
ARHGEF5Q12774 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ARHGEF5Q12774 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ARHGEF5Q12774 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ARHGEF5Q12774 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARHGEF5Q12774 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARHGEF5Q12774 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARHGEF5Q12774 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARHGEF5Q12774 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARHGEF5Q12774 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARHGEF5Q12774 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARHGEF5Q12774 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARHGEF5Q12774 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARHGEF5Q12774 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARHGEF5Q12774 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARHGEF5Q12774 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
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