Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC173Q0VFZ6 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms