Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAK6

LMOD3, Leiomodin-3, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD3Q0VAK6 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LMOD3Q0VAK6 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms