Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NIPAL4Q0D2K0 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms