Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLFN5Q08AF3 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SLFN5Q08AF3 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms