Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CD47Q08722 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CD47Q08722 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CD47Q08722 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CD47Q08722 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CD47Q08722 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CD47Q08722 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CD47Q08722 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CD47Q08722 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CD47Q08722 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CD47Q08722 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CD47Q08722 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CD47Q08722 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CD47Q08722 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CD47Q08722 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CD47Q08722 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CD47Q08722 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CD47Q08722 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CD47Q08722 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD47Q08722 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD47Q08722 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD47Q08722 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD47Q08722 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD47Q08722 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD47Q08722 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD47Q08722 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD47Q08722 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CD47Q08722 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD47Q08722 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD47Q08722 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD47Q08722 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD47Q08722 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD47Q08722 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD47Q08722 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD47Q08722 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD47Q08722 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD47Q08722 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD47Q08722 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD47Q08722 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD47Q08722 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CD47Q08722 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD47Q08722 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD47Q08722 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD47Q08722 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD47Q08722 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD47Q08722 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD47Q08722 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD47Q08722 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD47Q08722 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD47Q08722 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD47Q08722 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD47Q08722 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CD47Q08722 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD47Q08722 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD47Q08722 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD47Q08722 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD47Q08722 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD47Q08722 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD47Q08722 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD47Q08722 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD47Q08722 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD47Q08722 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD47Q08722 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CD47Q08722 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD47Q08722 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD47Q08722 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD47Q08722 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD47Q08722 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD47Q08722 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD47Q08722 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD47Q08722 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD47Q08722 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD47Q08722 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD47Q08722 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD47Q08722 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD47Q08722 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD47Q08722 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD47Q08722 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CD47Q08722 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD47Q08722 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD47Q08722 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD47Q08722 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD47Q08722 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD47Q08722 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD47Q08722 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD47Q08722 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD47Q08722 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CD47Q08722 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CD47Q08722 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CD47Q08722 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CD47Q08722 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CD47Q08722 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CD47Q08722 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CD47Q08722 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CD47Q08722 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CD47Q08722 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CD47Q08722 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CD47Q08722 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CD47Q08722 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CD47Q08722 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms