Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTDSPL2Q05D32 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTDSPL2Q05D32 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms