Protein–RNA interactions for Protein: Q04721

NOTCH2, Neurogenic locus notch homolog protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTCH2Q04721 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NOTCH2Q04721 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NOTCH2Q04721 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NOTCH2Q04721 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NOTCH2Q04721 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NOTCH2Q04721 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NOTCH2Q04721 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NOTCH2Q04721 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NOTCH2Q04721 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NOTCH2Q04721 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTCH2Q04721 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTCH2Q04721 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTCH2Q04721 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTCH2Q04721 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTCH2Q04721 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTCH2Q04721 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTCH2Q04721 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTCH2Q04721 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTCH2Q04721 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTCH2Q04721 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTCH2Q04721 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTCH2Q04721 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTCH2Q04721 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTCH2Q04721 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTCH2Q04721 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTCH2Q04721 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTCH2Q04721 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTCH2Q04721 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTCH2Q04721 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTCH2Q04721 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTCH2Q04721 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTCH2Q04721 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTCH2Q04721 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTCH2Q04721 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTCH2Q04721 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTCH2Q04721 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTCH2Q04721 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NOTCH2Q04721 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOTCH2Q04721 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOTCH2Q04721 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOTCH2Q04721 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOTCH2Q04721 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOTCH2Q04721 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOTCH2Q04721 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOTCH2Q04721 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOTCH2Q04721 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOTCH2Q04721 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NOTCH2Q04721 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NOTCH2Q04721 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NOTCH2Q04721 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NOTCH2Q04721 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOTCH2Q04721 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOTCH2Q04721 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOTCH2Q04721 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOTCH2Q04721 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOTCH2Q04721 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NOTCH2Q04721 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOTCH2Q04721 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOTCH2Q04721 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOTCH2Q04721 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOTCH2Q04721 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOTCH2Q04721 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOTCH2Q04721 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOTCH2Q04721 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOTCH2Q04721 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOTCH2Q04721 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOTCH2Q04721 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOTCH2Q04721 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NOTCH2Q04721 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOTCH2Q04721 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOTCH2Q04721 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOTCH2Q04721 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOTCH2Q04721 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOTCH2Q04721 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOTCH2Q04721 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOTCH2Q04721 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOTCH2Q04721 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOTCH2Q04721 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOTCH2Q04721 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOTCH2Q04721 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOTCH2Q04721 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOTCH2Q04721 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NOTCH2Q04721 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOTCH2Q04721 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOTCH2Q04721 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOTCH2Q04721 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOTCH2Q04721 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOTCH2Q04721 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NOTCH2Q04721 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NOTCH2Q04721 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOTCH2Q04721 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOTCH2Q04721 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NOTCH2Q04721 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NOTCH2Q04721 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NOTCH2Q04721 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NOTCH2Q04721 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NOTCH2Q04721 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NOTCH2Q04721 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NOTCH2Q04721 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NOTCH2Q04721 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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