Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GBE1Q04446 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms