Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
TOP2BQ02880 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC31.64■■■□□ 2.65
TOP2BQ02880 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC31.64■■■□□ 2.65
TOP2BQ02880 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.65
TOP2BQ02880 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
TOP2BQ02880 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
TOP2BQ02880 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
TOP2BQ02880 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
TOP2BQ02880 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
TOP2BQ02880 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
TOP2BQ02880 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
TOP2BQ02880 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
TOP2BQ02880 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
TOP2BQ02880 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
TOP2BQ02880 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
TOP2BQ02880 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC31.63■■■□□ 2.65
TOP2BQ02880 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
TOP2BQ02880 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
TOP2BQ02880 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
TOP2BQ02880 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
TOP2BQ02880 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
TOP2BQ02880 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
TOP2BQ02880 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
TOP2BQ02880 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
TOP2BQ02880 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
TOP2BQ02880 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
TOP2BQ02880 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
TOP2BQ02880 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
TOP2BQ02880 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
TOP2BQ02880 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
TOP2BQ02880 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
TOP2BQ02880 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
TOP2BQ02880 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
TOP2BQ02880 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
TOP2BQ02880 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
TOP2BQ02880 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
TOP2BQ02880 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
TOP2BQ02880 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
TOP2BQ02880 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
TOP2BQ02880 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
TOP2BQ02880 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
TOP2BQ02880 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
TOP2BQ02880 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
TOP2BQ02880 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
TOP2BQ02880 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
TOP2BQ02880 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
TOP2BQ02880 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
TOP2BQ02880 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
TOP2BQ02880 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
TOP2BQ02880 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
TOP2BQ02880 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
TOP2BQ02880 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
TOP2BQ02880 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
TOP2BQ02880 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
TOP2BQ02880 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
TOP2BQ02880 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
TOP2BQ02880 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
TOP2BQ02880 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
TOP2BQ02880 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
TOP2BQ02880 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
TOP2BQ02880 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
TOP2BQ02880 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
TOP2BQ02880 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
TOP2BQ02880 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
TOP2BQ02880 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
TOP2BQ02880 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
TOP2BQ02880 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
TOP2BQ02880 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
TOP2BQ02880 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
TOP2BQ02880 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
TOP2BQ02880 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
TOP2BQ02880 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
TOP2BQ02880 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC31.59■■■□□ 2.65
TOP2BQ02880 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
TOP2BQ02880 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
TOP2BQ02880 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
TOP2BQ02880 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
TOP2BQ02880 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
TOP2BQ02880 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
TOP2BQ02880 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
TOP2BQ02880 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
TOP2BQ02880 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
TOP2BQ02880 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
TOP2BQ02880 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
TOP2BQ02880 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
TOP2BQ02880 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC31.58■■■□□ 2.65
TOP2BQ02880 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
TOP2BQ02880 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
TOP2BQ02880 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
TOP2BQ02880 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
TOP2BQ02880 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
TOP2BQ02880 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
TOP2BQ02880 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
TOP2BQ02880 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
TOP2BQ02880 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
TOP2BQ02880 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
TOP2BQ02880 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
TOP2BQ02880 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
TOP2BQ02880 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
TOP2BQ02880 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms