Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTN2Q02246 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms