Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CDK16Q00536 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms