Protein–RNA interactions for Protein: P80098

CCL7, C-C motif chemokine 7, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL7P80098 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCL7P80098 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCL7P80098 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCL7P80098 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCL7P80098 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCL7P80098 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCL7P80098 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCL7P80098 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCL7P80098 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCL7P80098 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCL7P80098 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCL7P80098 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCL7P80098 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCL7P80098 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CCL7P80098 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL7P80098 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL7P80098 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL7P80098 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL7P80098 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL7P80098 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL7P80098 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL7P80098 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL7P80098 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL7P80098 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL7P80098 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL7P80098 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL7P80098 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL7P80098 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL7P80098 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL7P80098 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL7P80098 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL7P80098 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL7P80098 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL7P80098 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL7P80098 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL7P80098 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL7P80098 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL7P80098 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL7P80098 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCL7P80098 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL7P80098 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL7P80098 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL7P80098 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL7P80098 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL7P80098 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL7P80098 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL7P80098 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL7P80098 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL7P80098 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL7P80098 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL7P80098 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL7P80098 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL7P80098 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL7P80098 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL7P80098 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL7P80098 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL7P80098 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL7P80098 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL7P80098 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL7P80098 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL7P80098 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL7P80098 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL7P80098 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL7P80098 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL7P80098 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL7P80098 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL7P80098 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCL7P80098 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCL7P80098 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCL7P80098 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCL7P80098 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCL7P80098 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCL7P80098 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCL7P80098 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCL7P80098 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCL7P80098 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCL7P80098 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCL7P80098 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCL7P80098 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCL7P80098 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCL7P80098 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCL7P80098 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCL7P80098 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCL7P80098 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCL7P80098 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCL7P80098 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCL7P80098 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCL7P80098 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CCL7P80098 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCL7P80098 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCL7P80098 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CCL7P80098 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCL7P80098 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCL7P80098 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCL7P80098 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CCL7P80098 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCL7P80098 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCL7P80098 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCL7P80098 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCL7P80098 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms