Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SH3BP2P78314 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SH3BP2P78314 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SH3BP2P78314 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SH3BP2P78314 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SH3BP2P78314 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SH3BP2P78314 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SH3BP2P78314 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SH3BP2P78314 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SH3BP2P78314 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SH3BP2P78314 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SH3BP2P78314 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SH3BP2P78314 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SH3BP2P78314 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SH3BP2P78314 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SH3BP2P78314 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SH3BP2P78314 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SH3BP2P78314 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SH3BP2P78314 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SH3BP2P78314 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SH3BP2P78314 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SH3BP2P78314 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SH3BP2P78314 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SH3BP2P78314 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SH3BP2P78314 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SH3BP2P78314 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SH3BP2P78314 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SH3BP2P78314 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SH3BP2P78314 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SH3BP2P78314 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SH3BP2P78314 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SH3BP2P78314 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SH3BP2P78314 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SH3BP2P78314 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SH3BP2P78314 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SH3BP2P78314 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SH3BP2P78314 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SH3BP2P78314 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SH3BP2P78314 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SH3BP2P78314 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SH3BP2P78314 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SH3BP2P78314 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SH3BP2P78314 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SH3BP2P78314 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SH3BP2P78314 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SH3BP2P78314 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SH3BP2P78314 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BP2P78314 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BP2P78314 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BP2P78314 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BP2P78314 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BP2P78314 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BP2P78314 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BP2P78314 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BP2P78314 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BP2P78314 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BP2P78314 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BP2P78314 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BP2P78314 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BP2P78314 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BP2P78314 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BP2P78314 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BP2P78314 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BP2P78314 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BP2P78314 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BP2P78314 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BP2P78314 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BP2P78314 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BP2P78314 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BP2P78314 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SH3BP2P78314 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SH3BP2P78314 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SH3BP2P78314 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SH3BP2P78314 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SH3BP2P78314 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SH3BP2P78314 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SH3BP2P78314 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SH3BP2P78314 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SH3BP2P78314 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SH3BP2P78314 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SH3BP2P78314 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SH3BP2P78314 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SH3BP2P78314 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SH3BP2P78314 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SH3BP2P78314 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SH3BP2P78314 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SH3BP2P78314 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SH3BP2P78314 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SH3BP2P78314 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SH3BP2P78314 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SH3BP2P78314 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SH3BP2P78314 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SH3BP2P78314 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SH3BP2P78314 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SH3BP2P78314 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SH3BP2P78314 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SH3BP2P78314 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SH3BP2P78314 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SH3BP2P78314 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SH3BP2P78314 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms