Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERVK_113P63132 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERVK_113P63132 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERVK_113P63132 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERVK_113P63132 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERVK_113P63132 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERVK_113P63132 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERVK_113P63132 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERVK_113P63132 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERVK_113P63132 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERVK_113P63132 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERVK_113P63132 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERVK_113P63132 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERVK_113P63132 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERVK_113P63132 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERVK_113P63132 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERVK_113P63132 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERVK_113P63132 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERVK_113P63132 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERVK_113P63132 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERVK_113P63132 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERVK_113P63132 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERVK_113P63132 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERVK_113P63132 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERVK_113P63132 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERVK_113P63132 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERVK_113P63132 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERVK_113P63132 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERVK_113P63132 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERVK_113P63132 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERVK_113P63132 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HERVK_113P63132 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERVK_113P63132 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERVK_113P63132 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERVK_113P63132 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERVK_113P63132 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERVK_113P63132 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERVK_113P63132 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERVK_113P63132 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERVK_113P63132 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERVK_113P63132 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERVK_113P63132 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HERVK_113P63132 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERVK_113P63132 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HERVK_113P63132 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERVK_113P63132 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERVK_113P63132 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERVK_113P63132 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERVK_113P63132 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERVK_113P63132 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERVK_113P63132 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERVK_113P63132 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERVK_113P63132 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERVK_113P63132 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERVK_113P63132 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERVK_113P63132 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERVK_113P63132 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HERVK_113P63132 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERVK_113P63132 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERVK_113P63132 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERVK_113P63132 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERVK_113P63132 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERVK_113P63132 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERVK_113P63132 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERVK_113P63132 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERVK_113P63132 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERVK_113P63132 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERVK_113P63132 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERVK_113P63132 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERVK_113P63132 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HERVK_113P63132 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERVK_113P63132 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERVK_113P63132 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113P63132 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms