Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
MCCD1P59942 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MCCD1P59942 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
MCCD1P59942 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
MCCD1P59942 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MCCD1P59942 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
MCCD1P59942 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MCCD1P59942 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MCCD1P59942 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MCCD1P59942 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MCCD1P59942 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MCCD1P59942 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MCCD1P59942 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MCCD1P59942 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MCCD1P59942 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MCCD1P59942 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
MCCD1P59942 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
MCCD1P59942 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MCCD1P59942 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MCCD1P59942 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
MCCD1P59942 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MCCD1P59942 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MCCD1P59942 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
MCCD1P59942 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MCCD1P59942 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MCCD1P59942 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
MCCD1P59942 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MCCD1P59942 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MCCD1P59942 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
MCCD1P59942 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MCCD1P59942 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MCCD1P59942 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MCCD1P59942 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MCCD1P59942 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
MCCD1P59942 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MCCD1P59942 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MCCD1P59942 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
MCCD1P59942 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MCCD1P59942 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MCCD1P59942 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MCCD1P59942 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MCCD1P59942 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MCCD1P59942 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MCCD1P59942 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
MCCD1P59942 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MCCD1P59942 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MCCD1P59942 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MCCD1P59942 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MCCD1P59942 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MCCD1P59942 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
MCCD1P59942 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MCCD1P59942 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
MCCD1P59942 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MCCD1P59942 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MCCD1P59942 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MCCD1P59942 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MCCD1P59942 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MCCD1P59942 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MCCD1P59942 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MCCD1P59942 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MCCD1P59942 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MCCD1P59942 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MCCD1P59942 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MCCD1P59942 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MCCD1P59942 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms