Protein–RNA interactions for Protein: P56202

CTSW, Cathepsin W, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSWP56202 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTSWP56202 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTSWP56202 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTSWP56202 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CTSWP56202 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTSWP56202 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTSWP56202 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTSWP56202 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTSWP56202 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTSWP56202 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CTSWP56202 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTSWP56202 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTSWP56202 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTSWP56202 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTSWP56202 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CTSWP56202 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CTSWP56202 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CTSWP56202 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTSWP56202 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTSWP56202 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTSWP56202 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTSWP56202 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CTSWP56202 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CTSWP56202 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CTSWP56202 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CTSWP56202 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTSWP56202 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTSWP56202 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTSWP56202 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTSWP56202 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTSWP56202 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTSWP56202 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTSWP56202 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTSWP56202 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTSWP56202 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTSWP56202 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTSWP56202 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTSWP56202 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTSWP56202 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTSWP56202 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTSWP56202 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTSWP56202 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTSWP56202 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTSWP56202 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTSWP56202 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CTSWP56202 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTSWP56202 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTSWP56202 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTSWP56202 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTSWP56202 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTSWP56202 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTSWP56202 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTSWP56202 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTSWP56202 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTSWP56202 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTSWP56202 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTSWP56202 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTSWP56202 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CTSWP56202 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTSWP56202 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTSWP56202 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTSWP56202 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTSWP56202 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTSWP56202 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTSWP56202 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTSWP56202 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTSWP56202 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTSWP56202 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTSWP56202 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTSWP56202 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTSWP56202 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTSWP56202 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTSWP56202 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTSWP56202 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTSWP56202 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTSWP56202 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTSWP56202 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTSWP56202 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTSWP56202 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTSWP56202 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTSWP56202 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTSWP56202 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTSWP56202 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTSWP56202 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CTSWP56202 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTSWP56202 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTSWP56202 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTSWP56202 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTSWP56202 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTSWP56202 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTSWP56202 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTSWP56202 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTSWP56202 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CTSWP56202 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTSWP56202 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTSWP56202 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CTSWP56202 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTSWP56202 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTSWP56202 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTSWP56202 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms