Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF2A2P52657 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GTF2A2P52657 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GTF2A2P52657 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GTF2A2P52657 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
GTF2A2P52657 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2A2P52657 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2A2P52657 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2A2P52657 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2A2P52657 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2A2P52657 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2A2P52657 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2A2P52657 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2A2P52657 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2A2P52657 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2A2P52657 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2A2P52657 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2A2P52657 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2A2P52657 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2A2P52657 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2A2P52657 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2A2P52657 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2A2P52657 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2A2P52657 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2A2P52657 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2A2P52657 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2A2P52657 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2A2P52657 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2A2P52657 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2A2P52657 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2A2P52657 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2A2P52657 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2A2P52657 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF2A2P52657 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms