Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
SMARCA2P51531 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
SMARCA2P51531 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
SMARCA2P51531 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SMARCA2P51531 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SMARCA2P51531 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SMARCA2P51531 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
SMARCA2P51531 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
SMARCA2P51531 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
SMARCA2P51531 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
SMARCA2P51531 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
SMARCA2P51531 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SMARCA2P51531 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
SMARCA2P51531 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
SMARCA2P51531 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
SMARCA2P51531 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
SMARCA2P51531 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
SMARCA2P51531 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
SMARCA2P51531 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
SMARCA2P51531 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
SMARCA2P51531 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
SMARCA2P51531 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
SMARCA2P51531 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
SMARCA2P51531 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
SMARCA2P51531 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
SMARCA2P51531 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
SMARCA2P51531 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.98
SMARCA2P51531 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC33.7■■■□□ 2.98
SMARCA2P51531 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
SMARCA2P51531 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
SMARCA2P51531 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
SMARCA2P51531 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
SMARCA2P51531 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
SMARCA2P51531 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
SMARCA2P51531 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
SMARCA2P51531 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC33.69■■■□□ 2.98
SMARCA2P51531 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
SMARCA2P51531 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
SMARCA2P51531 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
SMARCA2P51531 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
SMARCA2P51531 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
SMARCA2P51531 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
SMARCA2P51531 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
SMARCA2P51531 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
SMARCA2P51531 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC33.68■■■□□ 2.98
SMARCA2P51531 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SMARCA2P51531 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
SMARCA2P51531 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
SMARCA2P51531 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
SMARCA2P51531 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
SMARCA2P51531 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SMARCA2P51531 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SMARCA2P51531 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SMARCA2P51531 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
SMARCA2P51531 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
SMARCA2P51531 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
SMARCA2P51531 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SMARCA2P51531 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SMARCA2P51531 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
SMARCA2P51531 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
SMARCA2P51531 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SMARCA2P51531 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
SMARCA2P51531 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SMARCA2P51531 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
SMARCA2P51531 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SMARCA2P51531 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC33.66■■■□□ 2.98
SMARCA2P51531 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
SMARCA2P51531 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
SMARCA2P51531 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
SMARCA2P51531 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
SMARCA2P51531 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
SMARCA2P51531 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
SMARCA2P51531 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC33.66■■■□□ 2.98
SMARCA2P51531 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
SMARCA2P51531 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
SMARCA2P51531 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
SMARCA2P51531 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
SMARCA2P51531 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
SMARCA2P51531 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
SMARCA2P51531 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
SMARCA2P51531 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
SMARCA2P51531 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
SMARCA2P51531 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
SMARCA2P51531 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
SMARCA2P51531 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
SMARCA2P51531 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
SMARCA2P51531 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
SMARCA2P51531 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
SMARCA2P51531 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
SMARCA2P51531 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
SMARCA2P51531 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
SMARCA2P51531 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
SMARCA2P51531 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
SMARCA2P51531 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
SMARCA2P51531 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
SMARCA2P51531 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
SMARCA2P51531 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
SMARCA2P51531 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
SMARCA2P51531 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
SMARCA2P51531 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms