Protein–RNA interactions for Protein: P51530

DNA2, DNA replication ATP-dependent helicase/nuclease DNA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNA2P51530 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DNA2P51530 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DNA2P51530 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DNA2P51530 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DNA2P51530 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DNA2P51530 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DNA2P51530 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DNA2P51530 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DNA2P51530 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DNA2P51530 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
DNA2P51530 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DNA2P51530 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DNA2P51530 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DNA2P51530 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DNA2P51530 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
DNA2P51530 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DNA2P51530 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DNA2P51530 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DNA2P51530 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DNA2P51530 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
DNA2P51530 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DNA2P51530 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DNA2P51530 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DNA2P51530 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DNA2P51530 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DNA2P51530 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DNA2P51530 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DNA2P51530 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DNA2P51530 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DNA2P51530 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DNA2P51530 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DNA2P51530 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DNA2P51530 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DNA2P51530 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
DNA2P51530 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DNA2P51530 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DNA2P51530 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DNA2P51530 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DNA2P51530 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DNA2P51530 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DNA2P51530 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DNA2P51530 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DNA2P51530 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DNA2P51530 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DNA2P51530 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DNA2P51530 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DNA2P51530 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
DNA2P51530 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DNA2P51530 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DNA2P51530 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DNA2P51530 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DNA2P51530 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DNA2P51530 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DNA2P51530 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DNA2P51530 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DNA2P51530 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DNA2P51530 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DNA2P51530 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
DNA2P51530 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DNA2P51530 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DNA2P51530 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DNA2P51530 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DNA2P51530 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DNA2P51530 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DNA2P51530 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DNA2P51530 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DNA2P51530 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DNA2P51530 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DNA2P51530 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DNA2P51530 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DNA2P51530 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DNA2P51530 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DNA2P51530 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DNA2P51530 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DNA2P51530 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DNA2P51530 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DNA2P51530 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DNA2P51530 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DNA2P51530 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DNA2P51530 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DNA2P51530 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DNA2P51530 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DNA2P51530 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DNA2P51530 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DNA2P51530 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DNA2P51530 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DNA2P51530 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DNA2P51530 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DNA2P51530 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DNA2P51530 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DNA2P51530 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DNA2P51530 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DNA2P51530 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DNA2P51530 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DNA2P51530 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DNA2P51530 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DNA2P51530 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DNA2P51530 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DNA2P51530 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DNA2P51530 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms