Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NUP153P49790 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NUP153P49790 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NUP153P49790 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
NUP153P49790 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NUP153P49790 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NUP153P49790 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NUP153P49790 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NUP153P49790 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NUP153P49790 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NUP153P49790 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NUP153P49790 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NUP153P49790 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NUP153P49790 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NUP153P49790 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NUP153P49790 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NUP153P49790 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NUP153P49790 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NUP153P49790 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NUP153P49790 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NUP153P49790 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NUP153P49790 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NUP153P49790 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NUP153P49790 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
NUP153P49790 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NUP153P49790 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NUP153P49790 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
NUP153P49790 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NUP153P49790 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NUP153P49790 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NUP153P49790 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NUP153P49790 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NUP153P49790 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NUP153P49790 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NUP153P49790 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NUP153P49790 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NUP153P49790 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NUP153P49790 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NUP153P49790 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NUP153P49790 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NUP153P49790 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
NUP153P49790 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NUP153P49790 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NUP153P49790 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
NUP153P49790 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NUP153P49790 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NUP153P49790 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NUP153P49790 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NUP153P49790 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
NUP153P49790 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NUP153P49790 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NUP153P49790 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NUP153P49790 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NUP153P49790 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NUP153P49790 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
NUP153P49790 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
NUP153P49790 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
NUP153P49790 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NUP153P49790 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NUP153P49790 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NUP153P49790 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NUP153P49790 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NUP153P49790 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NUP153P49790 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NUP153P49790 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NUP153P49790 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NUP153P49790 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
NUP153P49790 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
NUP153P49790 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NUP153P49790 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NUP153P49790 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NUP153P49790 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NUP153P49790 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NUP153P49790 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NUP153P49790 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NUP153P49790 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NUP153P49790 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NUP153P49790 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NUP153P49790 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NUP153P49790 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NUP153P49790 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NUP153P49790 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NUP153P49790 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NUP153P49790 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NUP153P49790 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
NUP153P49790 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
NUP153P49790 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
NUP153P49790 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.29
NUP153P49790 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
NUP153P49790 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
NUP153P49790 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NUP153P49790 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NUP153P49790 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NUP153P49790 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NUP153P49790 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
NUP153P49790 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NUP153P49790 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NUP153P49790 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NUP153P49790 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NUP153P49790 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms