Protein–RNA interactions for Protein: P49639

HOXA1, Homeobox protein Hox-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA1P49639 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HOXA1P49639 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HOXA1P49639 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HOXA1P49639 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HOXA1P49639 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HOXA1P49639 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HOXA1P49639 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HOXA1P49639 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA1P49639 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA1P49639 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA1P49639 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA1P49639 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA1P49639 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA1P49639 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA1P49639 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA1P49639 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA1P49639 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA1P49639 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA1P49639 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA1P49639 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA1P49639 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA1P49639 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA1P49639 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA1P49639 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA1P49639 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA1P49639 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA1P49639 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA1P49639 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA1P49639 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA1P49639 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA1P49639 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA1P49639 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HOXA1P49639 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms