Protein–RNA interactions for Protein: P46094

XCR1, Chemokine XC receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCR1P46094 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
XCR1P46094 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
XCR1P46094 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
XCR1P46094 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
XCR1P46094 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
XCR1P46094 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
XCR1P46094 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
XCR1P46094 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
XCR1P46094 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
XCR1P46094 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
XCR1P46094 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
XCR1P46094 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
XCR1P46094 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
XCR1P46094 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
XCR1P46094 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
XCR1P46094 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
XCR1P46094 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
XCR1P46094 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
XCR1P46094 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
XCR1P46094 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
XCR1P46094 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
XCR1P46094 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
XCR1P46094 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
XCR1P46094 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
XCR1P46094 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
XCR1P46094 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
XCR1P46094 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
XCR1P46094 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
XCR1P46094 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
XCR1P46094 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
XCR1P46094 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
XCR1P46094 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
XCR1P46094 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
XCR1P46094 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
XCR1P46094 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
XCR1P46094 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
XCR1P46094 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
XCR1P46094 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
XCR1P46094 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
XCR1P46094 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
XCR1P46094 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
XCR1P46094 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
XCR1P46094 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
XCR1P46094 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
XCR1P46094 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
XCR1P46094 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
XCR1P46094 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
XCR1P46094 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
XCR1P46094 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
XCR1P46094 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
XCR1P46094 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
XCR1P46094 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
XCR1P46094 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
XCR1P46094 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
XCR1P46094 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
XCR1P46094 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
XCR1P46094 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
XCR1P46094 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
XCR1P46094 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
XCR1P46094 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
XCR1P46094 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
XCR1P46094 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
XCR1P46094 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
XCR1P46094 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
XCR1P46094 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
XCR1P46094 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
XCR1P46094 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
XCR1P46094 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
XCR1P46094 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
XCR1P46094 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
XCR1P46094 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
XCR1P46094 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
XCR1P46094 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
XCR1P46094 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
XCR1P46094 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
XCR1P46094 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
XCR1P46094 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
XCR1P46094 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
XCR1P46094 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
XCR1P46094 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
XCR1P46094 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
XCR1P46094 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
XCR1P46094 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
XCR1P46094 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
XCR1P46094 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
XCR1P46094 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
XCR1P46094 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
XCR1P46094 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
XCR1P46094 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
XCR1P46094 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
XCR1P46094 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
XCR1P46094 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
XCR1P46094 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
XCR1P46094 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
XCR1P46094 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
XCR1P46094 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
XCR1P46094 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
XCR1P46094 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
XCR1P46094 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
XCR1P46094 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms