Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOBEC1P41238 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC1P41238 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms