Protein–RNA interactions for Protein: P41222

PTGDS, Prostaglandin-H2 D-isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDSP41222 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTGDSP41222 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PTGDSP41222 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms