Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MLH1P40692 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MLH1P40692 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
MLH1P40692 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MLH1P40692 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MLH1P40692 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
MLH1P40692 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MLH1P40692 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MLH1P40692 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MLH1P40692 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MLH1P40692 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MLH1P40692 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MLH1P40692 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MLH1P40692 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MLH1P40692 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MLH1P40692 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MLH1P40692 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MLH1P40692 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MLH1P40692 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MLH1P40692 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MLH1P40692 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MLH1P40692 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MLH1P40692 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MLH1P40692 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MLH1P40692 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MLH1P40692 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
MLH1P40692 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MLH1P40692 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MLH1P40692 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MLH1P40692 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MLH1P40692 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MLH1P40692 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MLH1P40692 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MLH1P40692 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MLH1P40692 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MLH1P40692 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MLH1P40692 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MLH1P40692 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MLH1P40692 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MLH1P40692 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MLH1P40692 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MLH1P40692 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MLH1P40692 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MLH1P40692 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MLH1P40692 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MLH1P40692 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MLH1P40692 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MLH1P40692 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
MLH1P40692 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MLH1P40692 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MLH1P40692 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MLH1P40692 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MLH1P40692 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
MLH1P40692 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MLH1P40692 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MLH1P40692 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MLH1P40692 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MLH1P40692 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MLH1P40692 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MLH1P40692 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MLH1P40692 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MLH1P40692 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MLH1P40692 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MLH1P40692 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MLH1P40692 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MLH1P40692 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MLH1P40692 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MLH1P40692 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MLH1P40692 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
MLH1P40692 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MLH1P40692 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MLH1P40692 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MLH1P40692 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MLH1P40692 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MLH1P40692 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MLH1P40692 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MLH1P40692 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MLH1P40692 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MLH1P40692 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
MLH1P40692 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MLH1P40692 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MLH1P40692 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MLH1P40692 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MLH1P40692 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MLH1P40692 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MLH1P40692 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MLH1P40692 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MLH1P40692 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MLH1P40692 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MLH1P40692 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MLH1P40692 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MLH1P40692 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
MLH1P40692 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MLH1P40692 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MLH1P40692 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MLH1P40692 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MLH1P40692 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
MLH1P40692 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MLH1P40692 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MLH1P40692 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms