Protein–RNA interactions for Protein: P37840

SNCA, Alpha-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCAP37840 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNCAP37840 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNCAP37840 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SNCAP37840 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNCAP37840 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNCAP37840 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNCAP37840 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNCAP37840 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNCAP37840 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNCAP37840 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNCAP37840 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNCAP37840 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNCAP37840 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNCAP37840 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNCAP37840 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNCAP37840 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNCAP37840 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNCAP37840 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNCAP37840 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNCAP37840 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNCAP37840 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNCAP37840 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNCAP37840 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNCAP37840 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNCAP37840 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNCAP37840 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNCAP37840 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNCAP37840 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SNCAP37840 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNCAP37840 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNCAP37840 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNCAP37840 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNCAP37840 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNCAP37840 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNCAP37840 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNCAP37840 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNCAP37840 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNCAP37840 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNCAP37840 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNCAP37840 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNCAP37840 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNCAP37840 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNCAP37840 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNCAP37840 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SNCAP37840 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNCAP37840 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNCAP37840 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SNCAP37840 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNCAP37840 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNCAP37840 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNCAP37840 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNCAP37840 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNCAP37840 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNCAP37840 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNCAP37840 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNCAP37840 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNCAP37840 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNCAP37840 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNCAP37840 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNCAP37840 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNCAP37840 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNCAP37840 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNCAP37840 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNCAP37840 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNCAP37840 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNCAP37840 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNCAP37840 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNCAP37840 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNCAP37840 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNCAP37840 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNCAP37840 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SNCAP37840 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNCAP37840 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNCAP37840 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNCAP37840 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNCAP37840 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNCAP37840 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNCAP37840 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNCAP37840 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNCAP37840 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNCAP37840 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNCAP37840 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNCAP37840 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNCAP37840 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNCAP37840 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNCAP37840 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNCAP37840 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNCAP37840 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNCAP37840 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNCAP37840 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNCAP37840 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNCAP37840 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNCAP37840 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNCAP37840 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNCAP37840 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNCAP37840 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNCAP37840 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNCAP37840 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNCAP37840 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SNCAP37840 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms