Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
FDFT1P37268 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FDFT1P37268 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms