Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TGFBR1P36897 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms