Protein–RNA interactions for Protein: P36873

PPP1CC, Serine/threonine-protein phosphatase PP1-gamma catalytic subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CCP36873 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PPP1CCP36873 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPP1CCP36873 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPP1CCP36873 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPP1CCP36873 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPP1CCP36873 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPP1CCP36873 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPP1CCP36873 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPP1CCP36873 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPP1CCP36873 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPP1CCP36873 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPP1CCP36873 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPP1CCP36873 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPP1CCP36873 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPP1CCP36873 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPP1CCP36873 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPP1CCP36873 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPP1CCP36873 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPP1CCP36873 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPP1CCP36873 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPP1CCP36873 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PPP1CCP36873 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPP1CCP36873 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPP1CCP36873 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PPP1CCP36873 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPP1CCP36873 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPP1CCP36873 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPP1CCP36873 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPP1CCP36873 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPP1CCP36873 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPP1CCP36873 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPP1CCP36873 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPP1CCP36873 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPP1CCP36873 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPP1CCP36873 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPP1CCP36873 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPP1CCP36873 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPP1CCP36873 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPP1CCP36873 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PPP1CCP36873 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPP1CCP36873 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPP1CCP36873 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPP1CCP36873 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPP1CCP36873 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPP1CCP36873 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPP1CCP36873 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PPP1CCP36873 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPP1CCP36873 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPP1CCP36873 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPP1CCP36873 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPP1CCP36873 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPP1CCP36873 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPP1CCP36873 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPP1CCP36873 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPP1CCP36873 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPP1CCP36873 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPP1CCP36873 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPP1CCP36873 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPP1CCP36873 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPP1CCP36873 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPP1CCP36873 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPP1CCP36873 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPP1CCP36873 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPP1CCP36873 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPP1CCP36873 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPP1CCP36873 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPP1CCP36873 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PPP1CCP36873 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPP1CCP36873 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PPP1CCP36873 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPP1CCP36873 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPP1CCP36873 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPP1CCP36873 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPP1CCP36873 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPP1CCP36873 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPP1CCP36873 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPP1CCP36873 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPP1CCP36873 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPP1CCP36873 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PPP1CCP36873 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPP1CCP36873 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPP1CCP36873 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PPP1CCP36873 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPP1CCP36873 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PPP1CCP36873 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PPP1CCP36873 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPP1CCP36873 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPP1CCP36873 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPP1CCP36873 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPP1CCP36873 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPP1CCP36873 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPP1CCP36873 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPP1CCP36873 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPP1CCP36873 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPP1CCP36873 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPP1CCP36873 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPP1CCP36873 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPP1CCP36873 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPP1CCP36873 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PPP1CCP36873 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms