Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC27P30260 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC27P30260 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC27P30260 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC27P30260 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC27P30260 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC27P30260 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC27P30260 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC27P30260 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC27P30260 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC27P30260 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDC27P30260 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC27P30260 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC27P30260 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC27P30260 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC27P30260 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC27P30260 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC27P30260 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC27P30260 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC27P30260 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC27P30260 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC27P30260 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC27P30260 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC27P30260 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC27P30260 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC27P30260 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC27P30260 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC27P30260 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC27P30260 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC27P30260 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC27P30260 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CDC27P30260 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC27P30260 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC27P30260 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC27P30260 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC27P30260 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC27P30260 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC27P30260 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC27P30260 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC27P30260 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC27P30260 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC27P30260 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC27P30260 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC27P30260 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC27P30260 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC27P30260 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC27P30260 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC27P30260 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC27P30260 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC27P30260 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDC27P30260 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDC27P30260 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDC27P30260 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDC27P30260 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDC27P30260 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDC27P30260 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDC27P30260 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CDC27P30260 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDC27P30260 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CDC27P30260 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDC27P30260 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CDC27P30260 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CDC27P30260 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDC27P30260 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CDC27P30260 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDC27P30260 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CDC27P30260 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDC27P30260 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDC27P30260 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDC27P30260 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDC27P30260 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDC27P30260 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC27P30260 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC27P30260 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC27P30260 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC27P30260 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC27P30260 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC27P30260 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC27P30260 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC27P30260 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC27P30260 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC27P30260 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC27P30260 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC27P30260 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC27P30260 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC27P30260 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC27P30260 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC27P30260 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC27P30260 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC27P30260 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC27P30260 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC27P30260 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC27P30260 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC27P30260 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC27P30260 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC27P30260 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC27P30260 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC27P30260 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC27P30260 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC27P30260 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms