Protein–RNA interactions for Protein: P29400

COL4A5, Collagen alpha-5(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A5P29400 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL4A5P29400 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL4A5P29400 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL4A5P29400 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL4A5P29400 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL4A5P29400 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL4A5P29400 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL4A5P29400 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL4A5P29400 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL4A5P29400 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL4A5P29400 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL4A5P29400 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
COL4A5P29400 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL4A5P29400 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL4A5P29400 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
COL4A5P29400 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL4A5P29400 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL4A5P29400 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL4A5P29400 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL4A5P29400 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL4A5P29400 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL4A5P29400 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL4A5P29400 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
COL4A5P29400 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL4A5P29400 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL4A5P29400 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
COL4A5P29400 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL4A5P29400 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL4A5P29400 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL4A5P29400 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL4A5P29400 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL4A5P29400 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL4A5P29400 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL4A5P29400 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL4A5P29400 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
COL4A5P29400 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL4A5P29400 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL4A5P29400 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
COL4A5P29400 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL4A5P29400 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
COL4A5P29400 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL4A5P29400 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL4A5P29400 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL4A5P29400 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL4A5P29400 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL4A5P29400 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL4A5P29400 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL4A5P29400 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
COL4A5P29400 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL4A5P29400 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL4A5P29400 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
COL4A5P29400 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
COL4A5P29400 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL4A5P29400 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms