Protein–RNA interactions for Protein: P28300

LOX, Protein-lysine 6-oxidase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXP28300 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LOXP28300 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LOXP28300 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LOXP28300 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LOXP28300 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LOXP28300 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LOXP28300 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LOXP28300 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LOXP28300 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LOXP28300 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LOXP28300 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LOXP28300 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LOXP28300 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LOXP28300 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LOXP28300 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LOXP28300 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LOXP28300 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LOXP28300 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LOXP28300 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LOXP28300 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LOXP28300 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LOXP28300 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LOXP28300 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LOXP28300 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LOXP28300 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LOXP28300 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LOXP28300 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LOXP28300 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LOXP28300 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LOXP28300 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LOXP28300 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LOXP28300 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LOXP28300 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LOXP28300 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LOXP28300 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LOXP28300 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LOXP28300 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LOXP28300 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LOXP28300 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LOXP28300 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LOXP28300 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LOXP28300 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LOXP28300 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LOXP28300 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LOXP28300 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LOXP28300 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LOXP28300 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LOXP28300 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LOXP28300 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LOXP28300 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LOXP28300 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LOXP28300 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LOXP28300 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LOXP28300 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LOXP28300 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LOXP28300 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LOXP28300 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LOXP28300 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LOXP28300 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LOXP28300 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LOXP28300 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LOXP28300 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LOXP28300 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LOXP28300 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LOXP28300 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LOXP28300 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LOXP28300 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LOXP28300 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LOXP28300 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LOXP28300 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LOXP28300 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LOXP28300 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LOXP28300 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LOXP28300 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LOXP28300 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LOXP28300 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LOXP28300 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LOXP28300 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LOXP28300 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LOXP28300 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LOXP28300 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LOXP28300 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LOXP28300 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LOXP28300 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LOXP28300 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LOXP28300 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LOXP28300 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LOXP28300 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LOXP28300 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LOXP28300 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LOXP28300 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LOXP28300 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LOXP28300 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LOXP28300 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LOXP28300 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LOXP28300 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
LOXP28300 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LOXP28300 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LOXP28300 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LOXP28300 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms