Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-DMAP28067 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms