Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTSSP25774 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTSSP25774 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTSSP25774 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CTSSP25774 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CTSSP25774 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CTSSP25774 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CTSSP25774 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTSSP25774 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTSSP25774 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTSSP25774 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTSSP25774 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTSSP25774 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CTSSP25774 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CTSSP25774 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
CTSSP25774 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CTSSP25774 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CTSSP25774 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTSSP25774 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTSSP25774 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTSSP25774 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTSSP25774 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTSSP25774 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTSSP25774 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTSSP25774 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTSSP25774 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CTSSP25774 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTSSP25774 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CTSSP25774 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTSSP25774 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTSSP25774 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTSSP25774 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTSSP25774 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CTSSP25774 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTSSP25774 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTSSP25774 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTSSP25774 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CTSSP25774 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTSSP25774 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTSSP25774 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTSSP25774 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTSSP25774 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTSSP25774 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTSSP25774 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTSSP25774 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTSSP25774 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTSSP25774 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTSSP25774 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTSSP25774 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTSSP25774 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTSSP25774 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTSSP25774 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTSSP25774 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTSSP25774 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTSSP25774 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTSSP25774 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTSSP25774 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CTSSP25774 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTSSP25774 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTSSP25774 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTSSP25774 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTSSP25774 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTSSP25774 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTSSP25774 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTSSP25774 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTSSP25774 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTSSP25774 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTSSP25774 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTSSP25774 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTSSP25774 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTSSP25774 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTSSP25774 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTSSP25774 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTSSP25774 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTSSP25774 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTSSP25774 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTSSP25774 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTSSP25774 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTSSP25774 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTSSP25774 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTSSP25774 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CTSSP25774 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTSSP25774 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTSSP25774 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CTSSP25774 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTSSP25774 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTSSP25774 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTSSP25774 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTSSP25774 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTSSP25774 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTSSP25774 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTSSP25774 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTSSP25774 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTSSP25774 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTSSP25774 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTSSP25774 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTSSP25774 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTSSP25774 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTSSP25774 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTSSP25774 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms