Protein–RNA interactions for Protein: P24522

GADD45A, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45AP24522 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GADD45AP24522 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GADD45AP24522 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GADD45AP24522 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GADD45AP24522 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GADD45AP24522 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GADD45AP24522 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GADD45AP24522 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GADD45AP24522 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GADD45AP24522 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GADD45AP24522 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GADD45AP24522 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GADD45AP24522 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GADD45AP24522 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GADD45AP24522 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GADD45AP24522 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GADD45AP24522 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GADD45AP24522 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GADD45AP24522 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GADD45AP24522 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GADD45AP24522 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GADD45AP24522 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GADD45AP24522 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GADD45AP24522 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GADD45AP24522 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GADD45AP24522 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GADD45AP24522 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GADD45AP24522 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GADD45AP24522 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GADD45AP24522 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GADD45AP24522 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GADD45AP24522 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GADD45AP24522 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GADD45AP24522 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GADD45AP24522 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GADD45AP24522 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GADD45AP24522 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GADD45AP24522 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GADD45AP24522 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GADD45AP24522 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GADD45AP24522 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GADD45AP24522 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GADD45AP24522 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GADD45AP24522 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GADD45AP24522 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GADD45AP24522 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GADD45AP24522 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GADD45AP24522 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GADD45AP24522 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GADD45AP24522 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GADD45AP24522 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GADD45AP24522 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GADD45AP24522 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GADD45AP24522 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GADD45AP24522 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GADD45AP24522 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GADD45AP24522 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GADD45AP24522 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GADD45AP24522 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GADD45AP24522 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GADD45AP24522 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GADD45AP24522 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GADD45AP24522 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GADD45AP24522 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GADD45AP24522 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GADD45AP24522 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GADD45AP24522 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GADD45AP24522 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GADD45AP24522 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GADD45AP24522 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GADD45AP24522 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GADD45AP24522 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GADD45AP24522 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GADD45AP24522 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GADD45AP24522 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GADD45AP24522 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GADD45AP24522 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GADD45AP24522 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GADD45AP24522 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GADD45AP24522 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GADD45AP24522 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GADD45AP24522 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GADD45AP24522 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GADD45AP24522 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GADD45AP24522 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GADD45AP24522 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GADD45AP24522 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GADD45AP24522 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GADD45AP24522 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GADD45AP24522 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GADD45AP24522 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GADD45AP24522 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GADD45AP24522 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GADD45AP24522 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GADD45AP24522 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GADD45AP24522 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GADD45AP24522 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GADD45AP24522 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GADD45AP24522 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GADD45AP24522 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms