Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PTPRBP23467 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPRBP23467 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms